Câu chuyện theo chân một cậu bé 16 tuổi chuyển đến trường trung học Shujin tại Tokyo, nơi cậu sống cùng bạn bè của cha mẹ. Tại đây, cậu gặp hai bạn học và một sinh vật bí ẩn giống như con mèo có tên là Morgana. Trong suốt thời gian ở trường, cậu cảm thấy khó chịu với môi trường xung quanh và cùng với những người bạn mới, họ thành lập một nhóm gọi là "Kẻ Trộm Phantom". Nhóm của họ hợp tác để thực hiện những vụ trộm, trong khi đối mặt với những hiện tượng kỳ lạ và các thử thách đầy bí ẩn.